Comenzó dirigiendo series documentales con enfoques ambientales, culturales y etnográficos, entre las cuales se destacan: RUTAS ANCESTRALES nominada en la categoría "Mejor Nuevo Formato de Televisión" en los Premios India Catalina de 2012, y NATURALEZA HUMANA ganadora del premio Paisaje Cultural Cafetero a mejor producción de televisión regional en el Festival de Cine y Televisión EscaletaFest 2019, y cuyo capítulo primero “Las Cumbres de la Vida” obtuvo mención honorífica en el Festival Internacional de Cine EcoFilmFest de Cittadella Italia en la categoría a mejor documental ambiental.
Ha dirigido tres cortometrajes experimentales: EL SUEÑO DEL ÁRBOL 2021ganador del estímulo “El Arte Sigue” 2021, producto de un laboratorio creativo desarrollado en el marco del proyecto “Talleres Lúdicos de la Imagen”; IKARI DANZANDO CON LA LUZ 2014 y MIEDO XX, este último producto de la exploración durante la cuarentena de 2020.
De igual manera ha dirigido dos cortos de ficción: LOS ABUSADORES, y LA MANO DERECHA, corto producto de un laboratorio creativo con jóvenes en el municipio de Circasia, ganador del premio Palma de Cera a mejor corto regional en el Festival Internacional de Cine en las Montañas 2022.
En el 2016 dirige el proyecto documental ARIBADA EL GUARDIAN DEL MONTE ganador del premio Palma de Cera en la categoría de Mejor Corto Regional en el Festival Internacional de Cine en las Montañas 2017, y, ganador del premio Kuntur Guagua a mejor corto infantil en el festival Iberoamericano de cine Azul SurRealidades 2018 e incluido en la Maleta de Cine Quindiano de 2019.
En el 2017 dirige SAGRADO, un reportaje documental con el pueblo indígena Pijao del Quindío y con el cual hace una gira itinerante en diferentes municipios del Eje Cafetero durante 2018, este trabajo fue seleccionado en el Festival de Cine de Bogotá en la sección de Cine Sagrado en 2019, y seleccionado en el Festival Internacional de Cine Suma Paz en 2021.
José Eugenio también ha incursionado en el campo de la video escena en donde ha producido piezas audiovisuales con enfoque cinematográfico en obras de teatro como HOMINUM PERDÓN POR SER 2017, y ENTRE LÍNEAS 2019, teatro documental expandido de la compañía Teatro Azul. En 2020 realizó la video escena de la obra ALEGRIA STATION, una coproducción entre el Teatro Mayor Julio Mario Santodomingo, la Compañía Teatro Azul de Armenia y el Teatro Español de Madrid, obra dirigida por la directora de teatro Natalia Menendez. En 2020 realiza un cortometraje de ficción incluido en la obra DIGNIDAD, obra ganadora de la beca de creación Mincultura “Colombia en Escena”, de la compañía de teatro Teatro Azul de Armenia.
Ha sido docente visitante de la Universidad de Manizales en las cátedras de fotografía documental y fotografía argumental, también fue tallerista en los Talleres Lúdicos de la Imagen realizados por la Fundación Viento de Cristal para la Alcaldía de Armenia y Corpocultura, donde realizó el reportaje ENTRE MUNDOS” 2014, experiencia ganadora del Premio “Colombia Inclusiva” otorgado por el Ministerio de la Protección Social en 2014. Este mismo año participó en el diseño, elaboración, implementación y realización del proyecto multimedial “SALVAGUARDA Y FOMENTO DE LA JARDINERÍA DOMÉSTICA COMO PATRIMONIO CULTURAL INMATERIAL”, realizado para el Ministerio de Cultura por la empresa 101 Media Solution´s.
Fue montajista del corto de ficción ANA Y LIBARDO del director Álvaro Aldana Barón, ganador del estímulo regional del Fondo para el Desarrollo Cinematográfico de Colombia FDC de 2016, y director de fotografía en el documental EL HOMBRE DE LAS IMÁGENES del mismo director, proyecto ganador de la Segunda Beca de Cinematografía del Quindío.